Journal article

Aplikasi Kandidat Pemindai untuk Diagnosis Gen Shiga like toxin-2 dari Escherichia coli O157 H7

I Wayan Suardana I NENGAH SUJAYA Prof. Dr. drh. Wayan Tunas Artama

Volume : 13 Nomor : 4 Published : 2012, December

Jurnal Veteriner

Abstrak

Ditemukannya Shiga-like toxin dari Escherichia coli O157:H7 pada feses sapi, daging sapi dan feses manusia, mengindikasikan keberadaan bakteri tersebut sebagai agen zoonosis sangat membahayakan dan mengancam kehidupan. Mengingat pentingnya E.coli O157:H7 bagi kesehatan masyarakat, analisis keragaman genetik Shiga Toxin Escherichia coli (STEC) serta pengembanan perangkat diagnostik seperti probe gena menjadi sangat penting dilakukan. Kegiatan penelitian diawali dengan tahapan perancangan dan sinteia probe PS2 dengan susunan nukleotida 5’TTACACATATATCAGTGCCCGGTGTGACAACGGTTTCCATGACAACGGACAGCAGTTATACCACTCTGCAACGTGTCGCAGCGCTGGAACGTTCCGGAATGCAAATCAGTCGTCA ‘3, dilanjutkan dengan analisis hasil pelabelan probe, ekstraksi DNA genom, hibridisasi dot blot DNA-DNA, dikahiri dengan deteksi hibridisasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa probe PS2 berhasil dikembangkan untuk mendeteksi gen Shiga like toksin (gen Stx2) dari E. coli O157:H7. Probe yang dirancang diketahui memiliki efisiensi pelabelan sampai 10 pg/?l. Probe PS2 dengan konsentrasi 25 ng/ml diketahui mampu mendeteksi komplementernya pada sampel sampai pada konsentrasi DNA template 10 ng/?l.