EN 
IN
Journal article
Analisis Sekuen Probe Gena Shiga Like Toxin-2 dari Isolat Lokal Escherichia coli O157 H7
I Wayan Suardana I NENGAH SUJAYA Prof. Dr. Drh. Wayan Tunas Artama
Volume : 14 Nomor : 2 Published : 2013, June
Jurnal Veteriner
Abstrak
Shiga-like toxin (stx) dari Escherichia coli O157:H7 yang telah ditemukan pada feses sapi, feses manusia dan daging sapi, mengindikasikan keberadaan bakteri tersebut sebagai agen zoonosis sangat membahayakan dan mengancam kehidupan. Mengingat pentingnya keberadaan E.coli O157:H7 tersebut terhadap kesehatan masyarakat, menjadikan analisis keragaman genetik Shiga Toxin Escherichia coli (STEC) serta pengembangan perangkat diagnostik seperti probe gena menjadi sangat penting dilakukan. Penelitian diawali dengan tahapan amplifikasi gen stx2, purifikasi gel hasil elektroforesis, sekuensing gena stx2, analisis filogenetik dan diakhiri dengan analisis sekuen kandidat probe diagnostik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat lokal E.coli O157:H7 SM25(1) hasil isolasi feses sapi memiliki struktur genetik yang homolog dengan isolat E.coli O157:H7 kontrol positip ATCC 43894. Hasil analisis kandidat probe berhasil merancang probe dengan pelabelan teknik PCR yang memiliki susunan primer foreward 5’-AATTTATATGTGGCCGGGTTC-‘3 dan primer reverse 5’-TGACGACTGATTTGCATTCC-‘3 yang diberi nama masing-masing sebagai primer PFS dan PRS, dengan panjang produk probe 176 bp.