Identifikasi Spesies Stafilokokus Pada Ikan Kerapu di Kabupaten Karangasem Dengan Analisis Sekuen 16S rRNA

Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies stafilokokus pada ikan kerapu di Kabupaten Karangasem. Sampel feses ikan dikumpulkan lalu ditumbuhkan pada media Blood Agar dan diidentifikasi dengan pewarnaan Gram. Kultur bakteri yang diduga stafilokokus, dimasukkan dalam media Chelex 10%. Fragmen gen 16S rRNA diamplifikasi dari DNA dengan Polymerase Chain Reaction (PCR) dengan primer spesifik stafilokokus. Produk PCR disekuensing di Barkley Sequencing Facility di Amerika Serikat. Hasil sekuensing diedit dan dirunutkan dengan MEGA5.0. Sekuen akhir dari setiap isolat disepadankan dengan database dari GenBank dengan fitur BLAST. Beberapa sekuens standar diunduh untuk mengkontruksi pohon filogenetik. Spesies yang dapat dikonfirmasi adalah Staphylococcus warneri dengan nilai homologi 100%.