Journal article

Kloning Gen Transcriptional Activator Protein dan Replication-Associated Protein dari Squash leaf curl China virus Penyebab Penyakit Daun Kuning pada Tanaman Mentimun

Ni Nengah Putri Adnyani I Dewa Made Putra Wiratama I GEDE RAI MAYA TEMAJA Sari Nurulita Gede Suastika

Volume : 14 Nomor : 1 Published : 2018, January

Jurnal Fitopatologi Indonesia

Abstrak

Penyakit daun kuning yang disebabkan oleh Squash leaf curl China virus (SLCCNV; Begomovirus) merupakan penyakit penting pada Cucurbitaceae yang terjadi di beberapa negara. Gejala yang mirip berupa daun keriting kuning ditemukan pada tanaman mentimun di Tabanan, Bali. Penelitian bertujuan untuk mendapatkan klon gen Transcriptional Activator Protein (TrAp) dan Replication-Associated Protein (Rep) SLCCNV isolat Indonesia. Pasangan primer universal Begomovirus SPG1/SPG2 digunakan untuk mengamplifikasi fragmen DNA Begomovirus yang mencakup gen TrAp dan Rep. Kloning amplikon berukuran ± 912 pb menggunakan metode TA-kloning pada vektor pTZ57R/T menghasilkan plasmid rekombinan pTZ-SLCCNV. Plasmid rekombinan pTZ-SLCCNV berhasil dikonfirmasi melalui koloni PCR dan perunutan DNA. Hasil analisis sikuen nukleotida pTZ-SLCCNV menunjukkan homologi yang tinggi (98%) antara SLCCNV isolat mentimun dari Bali dengan SLCCNV isolat labu dari Malaysia. Kata kunci: Begomovirus, plasmid rekombinan, primer universal, sikuen nukleotida