Keragaman Genetik dan Hubungan Kekerabatan Ayam Lokal Berdasarkan Penanda RAPD

Ayam lokal Indonesia merupakan plasma nutfah yang telah dimanfaatkan masyarakat untuk berbagai kebutuhan, seperti konsumsi, sarana upacara, koleksi, serta ayam aduan. Untuk menjaga kelestariannya perlu dilakukan upaya inventarisasi keragaman genetik menggunakan penanda molekuler. Penelitian ini bertujuan menentukan keragaman genetik dan hubungan kekerabatan empat ayam lokal Indonesia: ayam kampung, ayam ketawa, ayam kate lokal, dan ayam bekisar kangean, berdasarkan pendanda molekuler RAPD. DNA diekstraksi dari sampel darah 12 individu ayam lokal yang terdiri dari 3 ayam kampung, 3 ayam ketawa, 3 ayam kate lokal, dan 3 ayam bekisar kangean menggunakan Genomic DNA Mini Kit (Tissue) Geneaid. Analisis PCR-RAPD dilakukan menggunakan 6 primer, yaitu OPA 04, OPB 08, OPB 12, OPC 16, OPH 01, dan OPH 03. Produk PCR-RAPD dielektroforesis menggunakan agarose 1,5% dalam buffer TAE 1x. Hasil penelitian menunjukkan nilai kesamaan 12 individu ayam lokal menggunakan penanda RAPD berkisar dari 0% sampai dengan 100%. Hubungan kekerabatan 12 individu ayam lokal menggunakan penanda RAPD menunjukkan bahwa ayam yang memiliki kesamaan morfologi tidak mengelompok bersama. Hal ini menandakan bahwa kelompok ayam yang sama secara fenotipe belum tentu memiliki genotipe yang sama.